Le parcours de l'épreuve du marathon traverse 8 quartiers de Québec et est agrémenté des plus beaux attraits de la ville. Le temps réalisé lors de ce marathon est accepté comme temps de qualification pour le marathon de Boston. La programmation inclut également les épreuves suivantes : demi-marathon, 10 km Oasis, 5 km de la Santé SSQ, Course des jeunes Tanguay (5 km).

Note historique:
Jusqu'en 2016, le parcours du marathon démarrait à Lévis et rejoignait Québec en passant par la pont de Québec, avant de prendre fin dans le Vieux-Québec, face à la gare du Palais. Les coureurs se rendaient sur le rive-sud (Lévis) par le traversier puis étaient amenés au point de départ par des autobus. Fait exceptionnel, en 2011 la marathon a dû être annulé pour des raisons de sécurité, dû au passage de l'ouragan Irène (ou de ses restes) au dessus de Québec. Les coureurs ont pu compléter le demi-marathon à la place.